中科院生态中心 提出基因水平碱基分析新方法

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中科院生态中心 提出基因水平碱基分析新方法

日前，中科院生态环境中心汪海林研究组在5-羟甲基胞嘧啶（5hmC）分析方面取得重要进展，提出了对该物质进行分析的新方法。相关成果近日发表于《核酸研究》。
据了解，5hmC是科学家发现的第六种碱基，已在多种哺乳动物组织和细胞中检出。另外，多种肿瘤中5hmC水平偏低，使其有可能成为肿瘤早期诊断的生物标志物。目前，基因水平5hmC的分析依赖于限制性内切酶方法，而相关方法受到酶切位点限制，并且难以区分多5hmC位点的序列。
汪海林研究组提出利用硼酸与可葡萄糖基化的5hmC结合，发展新的基因水平5hmC分析方法。首先，采用T4噬菌体β-葡萄糖转移酶，在葡萄糖供体底物尿核苷二磷酸葡萄糖存在下，将葡萄糖基团转移至5hmC的羟基位置，从而生成葡萄糖基化5-羟甲基胞嘧啶。在此基础上，利用定量PCR分析。最终，研究人员发现硼酸可与葡萄糖基化5-羟甲基胞嘧啶中的邻二醇发生的共价作用，有效抑制聚合酶扩增反应的特点，可特异性地识别特定基因/片段中的5hmC。
业内专家表示，该方法不受酶切位点限制，可适用于各种细胞、各种序列中5hmC的分析鉴定，具有广阔的应用前景。

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Boronic acid-mediated polymerase chain reaction for gene- and fragment-specific detection of 5-hydroxymethylcytosine
http://nar.oxfordjournals.org/co ... /20/nar.gku216.full