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阿尔茨海默病(Alzheimer’sdisease,AD)是一种复杂的中枢神经系统退行性疾病。目前,阿尔茨海默病发病机理尚不十分清楚。随着人类基因组计划(Humangenomeproject,HGP)和高通量生物芯片技术的成功研发,人们广泛利用高通量全基因组生物芯片的技术手段,采用全基因组关联研究(Genome-WideAssociationStudies,GWAS)的方法筛选复杂阿尔茨海默病易感因素,取得了前所未有的成就。但是这些新识别的AD易感位点和基因只能解释部分的AD易感性,更多的易感因素需要进一步研究。2012年,中科院天津工业生物技术研究所陈祖耕研究组(基因组分析实验室)研究人员采用遗传通路的分析方法,分别分析了来自法国和美国的阿尔茨海默病GWAS数据(9580个样本)。研究人员发现celladhesionmolecules通路是在AD中连续出现的遗传信号。此研究成果发表于JournalofNeurochemistry杂志(IF=4.337)。(文章链接)
在此研究基础上,天津工业生物技术研究所陈祖耕研究组(基因组分析实验室)研究人员联合广东医学院和哈尔滨医科大学等单位的多位研究人员对来自欧洲的14138个样本(6399个AD疾病个体和7739个对照个体)进行了全基因组范围内基于基因和生物遗传通路水平上的分析。利用基因水平上关联检验的方法得到了1458个显著(P<0.05)的AD基因。然后采用生物遗传通路分析对1458个AD相关基因进行KEGG和GO遗传通路注释,结果发现了3个与心血管疾病有关的显著富集的KEGG通路:viralmyocarditis(hsa05416),dilatedcardiomyopathy(DCM)(hsa05414),hypertrophiccardiomyopathy(HCM)(hsa05410)。该研究结果首次从基因组和遗传通路水平上发现心血管疾病通路与AD的相关性,进一步验证了以前流行病学的研究发现。
该研究结果发表于NeurobiologyofAging杂志(IF=6.166)。该项研究工作获得了国家自然科学基金(81300945,31200934,31171219,81271213,81070878,81271214,和81261120404),广东省自然科学基金(NoS2012010008222),和广东医学院科技创新基金(No.STIF201101)的支持。
天津工业生物技术研究所基因组分析实验室助理研究员刘桂友为论文的第一作者。 |
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