标题: RNA编辑研究获进展 [打印本页] 作者: yhs210 时间: 2013-4-2 09:31 标题: RNA编辑研究获进展 3月27日，国际学术期刊《BMC基因组学》（BMC Genomics）在线发表了中科院上海生命科学研究院计算生物学所杨力研究组和生化与细胞所陈玲玲研究组的最新合作研究论文Prediction of constitutive A-to-I editing sites from human transcriptomes in the absence of genomic sequences。该项研究发展了一新的计算分析流程，在不需要相应基因组信息的情况下，仅通过对多个样本的RNA转录组信息进行比较，发现了体内存在的大量成簇RNA编辑新位点及其组织差异性调控。
在高等生物中，最主要的RNA编辑是A(adenosine)-to-I(Inosine) 的修饰，其受到蛋白酶ADAR（adenosine deaminases that act on RNA )的催化调控，编辑后腺苷酸(A)变成了次黄嘌呤核苷酸(I)。在翻译水平上，次黄嘌呤核苷酸(I)被识别为鸟核苷酸(G)，因此在该位点的编辑相当于A到G的转换，从而改变了所在位置的编码氨基酸序列，丰富了基因的多样性和多能性。同时，存在于非编码区的RNA编辑也可以通过影响RNA的可变剪接和细胞内定位等途径来改变RNA分子的功能和命运，因此RNA编辑调控对于转录后RNA的多样性和功能至关重要。近年来，高通量测序技术被广泛地应用于RNA编辑位点的预测分析，极大地推动了RNA编辑的研究。但是，由于高通量技术和后续计算分析的局限性，对RNA编辑在全转录组水平的精确预测还存在着很大的挑战。